针对西安航天神舟设计院部分管理功能不强、组织功能不能充分发挥的现状，普实创新以建立适宜的组织管理模式为目标，对设计院组织架构进行了重新设计。

普实创新综合一般企业组织结构的研究成果，有针对性的深入分析了国内现有设计院组织结构，在专业模式-直线制与综合模式-事业部制等组织结构形式的优缺点和适用环境进行了归类总结，进而提出以矩阵式和超矩阵式组织结构为基础的项目管理的运营方式来突破传统组织模式的思路。

在组织结构影响因素和组织设计基本原则的指导下，普实创新紧密围绕设计院“知识型企业组织”的定位，围绕服务战略、满足发展的核心目标，重新调整了领导决策机构、专业技术部门、职能支持部门、项目作业团队以形成适合市场化运作的组织结构。普实创新为设计院提供的矩阵式组织结构及项目管理运营方式，使设计院组织职能得以充分发挥、管理流程进一步优化、决策及管理的现代化水平得到提升，是适合设计院发展基础并能支撑战略实现的组织架构。